Gallium in the structure of uc(Nmr) Structure of Gallium Substituted Ferredoxin (pdb 2kaj)

The binding sites of Gallium atom in the structure of uc(Nmr) Structure of Gallium Substituted Ferredoxin (pdb code 2kaj). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Gallium atom. The 2kaj structure was solved by X.XU, M.UBBINK, D.B.KNAFF, with NMR in Solution technique. Gallium Binding Sites: Gallium binding site 1 out of 1 in 2kaj Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Gallium in the PDB 2kaj. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Gallium atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Ser45, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Ser45, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Ser45, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Leu25, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, A: Tyr37, A: Ser38, A: Cys39, A: Arg40, A: Ala41, A: Gly42, A: Ala43, A: Cys44, A: Ser45, A: Thr46, A: Cys47, A: Leu75, A: Cys77, conact list: Atom Atom Distance (A) Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HD23 A:Leu25 4.95 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 Ga HB2 A:Tyr37 4.55 Ga HA A:Tyr37 4.79 Ga N A:Ser38 4.96 Ga H A:Ser38 3.99 Ga HB2 A:Cys39 4.77 Ga N A:Cys39 4.31 Ga CB A:Cys39 4.04 Ga HB3 A:Cys39 4.44 Ga SG A:Cys39 2.43 Ga H A:Cys39 3.65 Ga C A:Cys39 4.44 Ga CA A:Cys39 4.50 Ga N A:Arg40 3.70 Ga C A:Arg40 4.93 Ga CA A:Arg40 4.31 Ga HA A:Arg40 3.83 Ga H A:Arg40 3.09 Ga N A:Ala41 4.43 Ga H A:Ala41 3.53 Ga N A:Gly42 4.40 Ga HA2 A:Gly42 4.21 Ga H A:Gly42 3.71 Ga CA A:Gly42 4.78 Ga N A:Ala43 4.50 Ga H A:Ala43 3.53 Ga O A:Cys44 4.88 Ga HB2 A:Cys44 4.63 Ga N A:Cys44 4.31 Ga CB A:Cys44 3.80 Ga HB3 A:Cys44 3.83 Ga SG A:Cys44 2.42 Ga H A:Cys44 4.00 Ga C A:Cys44 4.71 Ga CA A:Cys44 4.50 Ga CG2 A:Thr46 4.81 Ga HG21 A:Thr46 3.80 Ga HG22 A:Thr46 4.96 Ga H A:Thr46 4.89 Ga HB2 A:Cys47 3.03 Ga N A:Cys47 4.38 Ga CB A:Cys47 3.36 Ga HB3 A:Cys47 4.01 Ga SG A:Cys47 2.42 Ga H A:Cys47 3.75 Ga CA A:Cys47 4.51 Ga HD22 A:Leu75 4.24 Ga HB3 A:Leu75 4.52 Ga HD13 A:Leu75 4.25 Ga HB2 A:Cys77 3.58 Ga CB A:Cys77 3.31 Ga HB3 A:Cys77 3.12 Ga SG A:Cys77 2.43 Ga H A:Cys77 4.47 Ga CA A:Cys77 4.73 interactive model: